在台灣，總統就職典禮將至，卻傳出國民黨主席吳伯雄不滿座位安排，可能拒絕出席。
馬蕭辦公室表示，原本的座位安排是總統府規劃，吳伯雄被安排的「特二區」，原本就是馬蕭安排的第一排，馬蕭認為於公於私，吳伯雄都應獲得最大尊重，因此已重新安排吳伯雄坐到最前面的貴賓席。
《聯合報》報道，吳伯雄五二○就職慶典的座位被安排在「特二區」，與各在野黨主席一百多人坐在一起，被排在外賓、總統府官員、內閣官員與立委席的「特一區」之後，引發吳伯雄強烈不滿，吳伯雄還在黨內中山會報大發雷霆，當場退回邀請函，拒絕參加。
內定總統府發言人王郁琦表示，在典禮籌備階段，根據過去慣例，向來是「官前民後」，也就是由總統府規劃前排公職人員的座位，馬蕭辦公室規劃後排的民間團體座位，所以吳伯雄的座位原本是馬蕭辦公室負責規劃的最前面。
王郁琦說，官前民後的慣例未必不能變通，尤其於公，新政府就任後，吳伯雄主席就是執政黨的主席，理應受到很好的尊重，於私，馬英九對於吳伯雄在選舉期間所付出辛勞更十分感激，因此自始至終都用最尊重的方式對待吳伯雄。
王郁琦表示，如果籌備有不盡人意之處，馬蕭辦公室願意為此向大眾致歉，他強調由於座位有限，無法讓所有人都滿意，有時「順了姑意，逆了嫂意」，不過大家都等了八年，等待的就是這一刻，希望大家以最大的包容，以歡欣鼓舞的心情參加就職典禮。
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